Trường THCS Mỹ Chánh được thành lập theo Quyết định Số 01/QĐ-UBND ngày 02 tháng 01 năm 2007 của UBND huyện Phù Mỹ trên cơ sở tách từ trường THPT An Lương. Trường thực hiện nhiệm vụ giáo dục THCS đối với 02 xã Mỹ Chánh và xã Mỹ Chánh Tây nên có 02 điểm trường. Điểm trường chính tại thôn Chánh Thiện xã Mỹ Chánh huyện Phù Mỹ tỉnh Bình Định, diện tích 9850.7m2.  Điểm trường lẻ tại thôn Trung Hậu xã Mỹ Chánh Tây huyện Phù Mỹ tỉnh Bình Định. Diện tích 6399.2m2.

Đội ngũ CBQL quản lý (CBQL), Giáo viên (GV), nhân viên (NV) của nhà trường trong những năm qua đã đoàn kết một lòng, học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh, ra sức phấn đấu thi đua học tập và nâng cao nghiệp vụ, sử dụng phương pháp dạy học tích cực, ứng dụng công nghệ thông tin, áp dụng chuẩn kiến thức kĩ năng trong soạn giảng và đã hoàn thành tốt nhiệm vụ. Chính vì vậy, nhà trường đã được công nhận đạt chuẩn Quốc gia năm 2016 (theo Quyết định số 5069/QĐ-UBND ngày 30/12/2016 của UBND tỉnh Bình Định). Trường có hạt nhân lãnh đạo là chi bộ Đảng gồm 56 đảng viên, nhiều năm Chi bộ được đánh giá hoàn thành tốt và hoàn thành xuất sắc nhiệm vụ. Tổ chức Công đoàn luôn làm tốt vai trò, trách nhiệm, chăm lo cho công đoàn viên trong công tác và đời sống.

Năm học 2020-2021, Trường THCS Mỹ Chánh có 28 lớp, 963 học sinh. Đội ngũ cán bộ giáo viên gồm 67 người; trong đó giáo viên 59 người; cán bộ quản lý, nhân viên là 08 người. Cơ sở vật chất của trường đảm bảo phục vụ tốt cho công tác dạy và học. Chất lượng giáo dục của nhà trường từng bước được nâng lên lên. Cụ thể:

- Tuyển sinh vào lớp 6 hàng năm đạt 100%.

- HS bỏ học 0.1% (01/966 HS).

- HS lên lớp thẳng 98.3%.

- Công tác nâng cao chất lượng dạy học đạt kết quả khá tốt:

+ Thi GV dạy giỏi cấp huyện đạt 03 GV.

+ Thi HSG cấp tỉnh đạt 05 giải. Cấp huyện đạt 21 giải.

+ Thi KHKT cấp huyện đạt 02 giải.

+ Thi Hội khỏe Phù Đổng cấp Huyện: đạt 03 giải tập thể và 06 giải cá nhân.

+ Thi Sáng kiến cấp huyện đạt 02 SK.

Từ năm học 2016-2017 đến năm học 2020-2021, trường luôn được các cấp công nhận các danh hiệu thi đua và tặng Giấy khen. Trong đó, năm học 2017-2018 và 2019-2020 trường được công nhận Tập thể lao động Xuất sắc và được UBND huyện Phù Mỹ tặng Giấy khen.

Năm học 2021-2022, Trường THCS Mỹ Chánh có 26 lớp, 965 học sinh. Đội ngũ cán bộ giáo viên gồm 66 người; trong đó giáo viên 58 người; cán bộ quản lý, nhân viên là 08 người. Cơ sở vật chất của trường đảm bảo phục vụ tốt cho công tác dạy và học. Chất lượng giáo dục của nhà trường từng bước được nâng lên.